Шығыс Қазақстан – еліміздегі суға ең бай аймақтардың бірі болып саналады. Оның табиғи ресурстары: ірі өзендер, ең таза көлдер және су қоймалары орналасқан.
Шығыс Қазақстанның өзендері Солтүстік Мұзды мұхит алыбына (Ертіс өзені арқылы) және ішкі тұйық алыбына (Балқаш–Алакөл) жатады.
Облыстың су ресурстарына мыналар кіреді:
- 1200-ден астам өзен бар, олардың 885-і – ұзындығы 10–100 км аралығында, ал 100 км-ден асатын өзендер саны – небәрі 20.
Негізгі су қоймалары – Ертіс (ірі салалары: Үлбі, Бұқтырма, Күршім, Шар, Қызылсу), Бұқтырма су қоймалары. Бұл су қоймалары Өскемен (1952 ж.) және Бұқтырма (1960 ж.) гидроэлектр станциялары салынуының нәтижесінде пайда болған. - 2000 көл бар, олардың 1003-і көлемі бір гектардан асатын көлдер.
Көлдер аймақ бойынша біркелкі орналаспаған: көпшілігі солтүстік бөлікте, ал ірілері – оңтүстікте, аңғарлар мен тауаралық ойыстарда. Тауларда шағын көлдер көп кездеседі. Ең ірі көлдер – Марқакөл, Зайсан, Сібе көлдері, Маралды, Рахман, Сасыккөл.
